Søen har tilsyneladende siden sin opståen stabiliseret sig i en klarvandet tilstand med udbredt undervandsvegetation. Årsagen hertil er utvivlsomt den meget næringsfattige jordbund og den beskyttede beliggenhed i skov.
Da Schoubyes Sø søen er så ung en sø, må det forventes, at plante- og dyrelivet i søen ændrer sig med årene.
Schoubyes Sø er lille og lavvandet. Den har således kun en gennemsnitsdybde på ca. 0,8 meter med en maksimaldybde på 2,1 meter. Vandstanden svinger imidlertid ret kraftigt; således spirede der lyng på søbunden i de tørre somre midt i 1990’erne.
==Fakta:==